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總RNA測序

福彩双色球重号走势图 www.gbofnb.com.cn 利用TruSeq Stranded Total RNA試劑盒開展的總RNA測序(全轉錄組分析)可得到最完整的轉錄組圖像,包括編碼RNA和多種形式的非編碼RNA。它可實現高度靈敏且準確的表達定量,以及鑒定轉錄組中已知的和新的特征。


Ribo-Zero試劑盒可高效去除高豐度的RNA種類,同時保留片段化和完整的轉錄本從而用于文庫構建。總RNA測序(total RNA-Seq)在正常和低質量的FFPE樣品中都能夠實現最佳覆蓋。


總RNA測序的優點:
Total RNA-Seq分析編碼RNA和多種形式的非編碼RNA,從而提供對轉錄組的全面視圖。
鑒定已知的和新的轉錄特征
使研究人員能夠在最廣泛的轉錄本中鑒定生物標志物
可實現對感興趣的表型更加全面的了解
允許在很寬的動態范圍內分析轉錄組
mRNA測序
mRNA測序(mRNA-Seq)已迅速成為分析疾病狀況、生物過程及廣泛研究設計中的轉錄組的首選方法。mRNA-Seq不僅可提供極為準確且高靈敏度的量化基因表達,還可識別已知的和新的轉錄異構體、基因融合和其他特征及等位基因特異性表達。mRNA-Seq可提供編碼轉錄組的完整視圖,而并不受限于先驗知識。


mRNA測序的優勢
與基因表達芯片相比,mRNA-Seq在分析轉錄組方面具有諸多優勢。
該方法適用于更廣泛的動態范圍,不僅可增加靈敏度,還可提高基因表達中測量的倍數變化的準確性。
可捕獲已知特征和新發特征
可廣泛應用于眾多物種


靶向RNA測序

靶向RNA測序是一種測定感興趣轉錄本表達的高度準確且特異的方法,同時提供定量和定性信息。能實現表達分析鑒定融合基因。Illumina為特定RNA測序提供預制和定制兩種方案。


這種方法的應用包含:
選定特定基因的表達譜分析,以評估疾病相關的變異和表觀遺傳學改變
基因融合和基因表達變化分析以提供癌癥中功能相關的改變的特定視角
研究包括NFkB,P450及細胞凋亡等在內的各種信號轉導通路相關的基因


靶向RNA測序的優勢
設計靶向的RNA表達集合,重點關注感興趣的RNA序列,或添加定制內容到全面優化且經過實驗驗證的基因集合。
為測定感興趣的轉錄本提供一種高度準確而特異的方法
利用定性和定量信息來實現差異表達分析、等位基因特異的表達測定和融合基因驗證
同時測定數十個至數千個靶點
兼容低質量或FFPE來源的RNA樣品


小RNA測序

隨著新一代測序的不斷發展以及Illumina驚人的數據通量和多重分析能力,基于測序的小RNA分析方法被迅速采用,以便在轉錄和轉錄后水平研究基因調控。小RNA測序技術具有前所未有的靈敏度和動態范圍,可同時對數以千計的小RNA和miRNA進行檢測,適合探索小RNA和圖譜分析應用。


利用小RNA測序技術,無需預先假設,即可發現新的microRNA,以單堿基分辨率鑒定變異(如isomirs),并可分析任何樣品中所有小RNA的差異表達。TruSeq Small RNA Library Prep Kit支持在17-35 bp范圍內的自主完成片段篩選,以檢測不同樣品之間小RNA的差異表達。


小RNA測序的優勢
直接從總RNA生成miRNA測序文庫,以便了解非編碼RNA的作用。
了解轉錄后調控如何促成表型
鑒定新穎的生物標志物
捕獲完整的小RNA和miRNA


超低起始樣本與單細胞RNA測序

采用高度靈敏的RNA測序(RNA-Seq)方法,現在可實現超低起始樣本量、甚至單細胞的基因表達分析。單細胞測序是用來檢測個別細胞的基因組或轉錄組的方法,能以高分辨率顯示細胞之間的不同變異。


使用超低起始樣本與單細胞RNA-Seq,您可以探索一個器官或腫瘤中不同細胞的獨特生物形態,并了解對各環境因素的亞群反應。這些方法都有利于生物學家在分化、增殖、腫瘤形成等時間依賴的過程中研究細胞功能和異質性。


超低起始樣本與單細胞RNA測序的優勢
超低起始樣本與單細胞RNA測序是一個功能強大的工具,可以用來從最小量的起始材料中研究整個轉錄組(包括剪接點和選擇性剪接)。
簡單的樣本制備 — 可在整個細胞上直接操作的單管操作流程,有助于保留樣本的完整性
無可比擬的靈敏度 — 以單細胞或10 pg的總RNA(輸入范圍:1–1,000個細胞或10 pg–10 ng的總RNA)作為起始模板
高質量的RNA-Seq數據 — 可保留全長基因信息、低比例的rRNA片段以及高表達的高GC含量轉錄本。


核糖體分析

核糖體分析是一種對核糖體?;さ膍RNA片段進行深度測序的方法。這些片段的純化和測序提供了在特定時間點細胞內活躍的核糖體的“快照”。這一信息可確定細胞中哪些蛋白質正在積極翻譯。
 
核糖體分析實現了細胞翻譯過程的系統監測以及蛋白質豐度的預測。確定哪些區域的信息被翻譯可幫助定義復雜生物體的蛋白質組。與Illumina的大規模并行、高通量的測序相結合,核糖體分析帶來了準確而詳盡的蛋白質生成體內分析。


核糖體分析的優勢
識別正在翻譯的轉錄本,以發現基因調控的重要信息。
研究翻譯控制,測定基因表達
識別翻譯起始位點
確定蛋白合成速率
預測蛋白豐度